Le seguenti righe devono essere aggiunte al file SVF, a seconda del quanti dispositivi prima e/o dopo il dispositivo Stratix II nella catena JTAG. È necessario conoscere il registro delle istruzioni e bypassare la lunghezza del registro di tutti gli altri dispositivi della catena. Aggiungere le righe dopo la riga FREQUENCY nel file SVF:
HIR 10 TDI (3FF); 'TIR 10 TDI (3FF); 'TDI HDR 1 (1); 'TDR 1 TDI (1); '
È necessario modificare la parte controllando anche il dispositivo JTAG IDCODE. Ad esempio, se si utilizza un EP2S130, per impostazione predefinita il file ha la seguente riga:
SDR 32 TDI (FFFFFFFF) TDO (020950DD) MASK (0FFFFFFF);
Aggiungere la riga seguente poco prima della riga precedente:
SIR 10 TDI (006);
Il file SVF può ora essere utilizzato per programmare la chiave di sicurezza. Tuttavia, queste modifiche da sole non controllano la tensione di programmazione da 3,7 V.