Le istanze Intel® per i carichi di lavoro HPC
I test seguenti sono stati condotti su istanze AWS basate su diverse generazioni di processori Intel® Xeon® in una configurazione hyper-threaded. Questo processore su misura può raggiungere una velocità di clock turbo all-core fino a 3,5 GHz ed è dotato di tecnologia Intel® Turbo Boost 2.0, Intel® Advanced Vector Extensions 512 (Intel® AVX-512) e Intel® Deep Learning Boost. Questi nuovi prodotti offrono una proposta di maggiore valore per i carichi di lavoro general purpose e memory intensive rispetto alla generazione precedente (ad esempio, maggiore scalabilità e CPU migliorata), oltre a prestazioni migliori.
Che cos'è GROMACS?
L'applicazione GROMACS è un'applicazione basata sul calcolo (FLOPS). I carichi di lavoro in questa applicazione sono sensibili alla latenza per qualsiasi comunicazione (socket-socket, CPU-GPU e multi-nodo). Prende benefici da AVX-512 (Y), basata su calcolo (Y) (esclusi gli ionchannel, è basata su MPI a 8-16 nodi), benefici da turbo (Y), benefici da HT/SMT (Y).
I carichi di lavoro che abbiamo considerato per il nostro benchmarking sono disponibili pubblicamente:
- lignocellulosa (atomi 3 M, tipo RF); la lignocellulosa è utile come esempio per dimostrare la scalabilità.
- water_rf (atomi 1,5 M, tipo RF)
Come ottenere i vantaggi Intel®
I processori scalabili Intel® Xeon® di terza generazione offrono vantaggi significativi in termini di prestazioni per il carico di lavoro GROMACS che sono accelerati dalle tecnologie Intel AVX-512 e Intel Deep Learning Boost. Questa accelerazione offre vantaggi significativi risultando in un numero inferiore dei nodi (più del doppio). Diventa più limitato con lo scalare verso un numero maggiore di nodi per via della minore larghezza di banda di rete di C6i.32xlarge e M6i.32xlarge. I clienti che eseguono questo carico di lavoro GROMACS possono ottenere notevoli miglioramenti delle prestazioni eseguendo l'implementazione su tipi di istanze scalabili Intel® Xeon® di terza generazione in AWS (M6i, C6i) rispetto ai processori scalabili Intel® Xeon® delle generazioni precedenti in AWS.
Risorse: www.intel.it/HPC